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Equipe Génétique et biologie des tumeurs pédiatriques

Institut Curie, 26 rue d’Ulm, Paris

 

Membres

– COSTA Ana Post-Doc
– DELATTRE Olivier DRE Inserm
– DURAND Simon Etudiant Thèse
– GROSSETETE-LALAMI Sandrine IR2 Inserm
– GRUEL Nadège IR2 Curie
– JANOUEIX-LEROSEY Isabelle DR2 Inserm
– LAUD Karine IR2 Curie
– LOUIS Caroline AI Inserm
– MIRABEAU Olivier IR2 Curie
– PELTIER Agathe Etudiante Thèse
– PIERRE-EUGENE Cécile IE2 Curie
– POULAIN Laury Post-doc
– RAYNAL Virginie AI Inserm
– SAULNIER Olivier Etudiant Thèse
– SURDEZ Didier IR Curie
– ZAÏDI Sakina IE CDD
– ZULINI Justine IE CDD

 

 

Thématiques de recherche en oncopédiatrie

Tumeurs pédiatriques étudiées : Sarcome d’Ewing/Neuroblastome/Tumeurs rhaboïdes
Ces trois tumeurs représentent des modèles de tumeurs extrêmement agressives mais caractérisées par des altérations génétiques en nombre limité et dont le caractère causal a été clairement établi par des modèles cellulaires et animaux.

Questions générales :
• Définir les altérations moléculaires des tumeurs pédiatriques
• Élucider la nature des cellules progénitrices qui donnent naissance à ces cancers
• Déterminer les relations qu’il existe entre cellules souches normales et cancéreuses.

Approches :
• Identification et caractérisation fonctionnelle de nouvelles altérations génétiques dans les sarcomes indifférenciés
• Etudes fonctionnelles des gènes EWS-FLI1, ALK, STAG2 et SMARCB1
• Caractérisation de l’hétérogénéité génétique et non-génétique des cellules tumorales
• Etude des interactions entre modifications somatiques et contexte constitutionnel
• Analyse de l’identité cellulaire et de la plasticité dans le neuroblastome et le sarcome d’Ewing.

Méthodes d’étude
Outils classiques de biologie moléculaire : siRNA et shRNA, CRISPR/Cas9, sur-expression, protéine taggée fluorescente, anticorps, inhibiteurs pharmacologiques.
Analyses des altérations génétiques et épigénétiques par NGS (WGS, WES, RNA-seq, ChIP-seq, HiChIP…), études sur cellules uniques.
Screening de banques, FACS, IHC.

 

Collaborations

– SJ Chanock, USA
– JF Amatruda, USA
– H Kovar, Autriche
– T Grunewald, Allemagne
– V Combaret, France

 

Partenariats

Service de Pédiatrie de l’Institut Curie et équipes d’oncologie pédiatrique de la SFCE.

 

Contact

isabelle.janoueix-lerosey@curie.fr

 

Publications

Genome-wide association study identifies multiple new loci associated with Ewing sarcoma susceptibility. Machiela MJ, Grünewald TGP, Surdez D, Reynaud S, Mirabeau O, Karlins E, Rubio RA, Zaidi S, Grossetete-Lalami S, Ballet S, Lapouble E, Laurence V, Michon J, Pierron G, Kovar H, Gaspar N, Kontny U, González-Neira A, Picci P, Alonso J, Patino-Garcia A, Corradini N, Bérard PM, Freedman ND, Rothman N, Dagnall CL, Burdett L, Jones K, Manning M, Wyatt K, Zhou W, Yeager M, Cox DG, Hoover RN, Khan J, Armstrong GT, Leisenring WM, Bhatia S, Robison LL, Kulozik AE, Kriebel J, Meitinger T, Metzler M, Hartmann W, Strauch K, Kirchner T, Dirksen U, Morton LM, Mirabello L, Tucker MA, Tirode F, Chanock SJ, Delattre O. Nat Commun. 2018 Aug 9;9(1):3184. doi: 10.1038/s41467-018-05537-2.

PAX3-FOXO1 transgenic zebrafish models identify HES3 as a mediator of rhabdomyosarcoma tumorigenesis. Kendall GC, Watson S, Xu L, LaVigne CA, Murchison W, Rakheja D, Skapek SX, Tirode F, Delattre O, Amatruda JF. Elife. 2018 Jun 5;7. pii: e33800. doi: 10.7554/eLife.33800.

Transcriptomic definition of molecular subgroups of small round cell sarcomas. Watson S, Perrin V, Guillemot D, Reynaud S, Coindre JM, Karanian M, Guinebretière JM, Freneaux P, Le Loarer F, Bouvet M, Galmiche-Rolland L, Larousserie F, Longchampt E, Ranchere-Vince D, Pierron G, Delattre O, Tirode F. J Pathol. 2018 May;245(1):29-40. doi: 10.1002/path.5053.

Activated ALK signals through the ERK-ETV5-RET pathway to drive neuroblastoma oncogenesis. Lopez-Delisle L, Pierre-Eugène C, Louis-Brennetot C, Surdez D, Raynal V, Baulande S, Boeva V, Grossetête-Lalami S, Combaret V, Peuchmaur M, Delattre O, Janoueix-Lerosey I. Oncogene. 2018 Mar;37(11):1417-1429. doi: 10.1038/s41388-017-0039-5.

Heterogeneity of neuroblastoma cell identity defined by transcriptional circuitries. Boeva V, Louis-Brennetot C, Peltier A, Durand S, Pierre-Eugène C, Raynal V, Etchevers HC, Thomas S, Lermine A, Daudigeos-Dubus E, Geoerger B, Orth MF, Grünewald TGP, Diaz E, Ducos B, Surdez D, Carcaboso AM, Medvedeva I, Deller T, Combaret V, Lapouble E, Pierron G, Grossetête-Lalami S, Baulande S, Schleiermacher G, Barillot E, Rohrer H, Delattre O, Janoueix-Lerosey I. Nat Genet. 2017 Sep;49(9):1408-1413. doi: 10.1038/ng.3921.

DNA methylation heterogeneity defines a disease spectrum in Ewing sarcoma. Sheffield NC, Pierron G, Klughammer J, Datlinger P, Schönegger A, Schuster M, Hadler J, Surdez D, Guillemot D, Lapouble E, Freneaux P, Champigneulle J, Bouvier R, Walder D, Ambros IM, Hutter C, Sorz E, Amaral AT, de Álava E, Schallmoser K, Strunk D, Rinner B, Liegl-Atzwanger B, Huppertz B, Leithner A, de Pinieux G, Terrier P, Laurence V, Michon J, Ladenstein R, Holter W, Windhager R, Dirksen U, Ambros PF, Delattre O, Kovar H, Bock C, Tomazou EM. Nat Med. 2017 Mar;23(3):386-395. doi: 10.1038/nm.4273. Epub 2017 Jan 30.

Cooperation between somatic mutations and germline susceptibility variants in tumorigenesis – a dangerous liaison. Grünewald TG, Delattre O. Mol Cell Oncol. 2015 Oct 6;3(3):e1086853. doi: 10.1080/23723556.2015.1086853.

Combined experience of six independent laboratories attempting to create an Ewing sarcoma mouse model. Minas TZ, Surdez D, Javaheri T, Tanaka M, Howarth M, Kang HJ, Han J, Han ZY, Sax B, Kream BE, Hong SH, Çelik H, Tirode F, Tuckermann J, Toretsky JA, Kenner L, Kovar H, Lee S, Sweet-Cordero EA, Nakamura T, Moriggl R, Delattre O, Üren A. Oncotarget. 2017 May 23;8(21):34141-34163. doi: 10.18632/oncotarget.9388.

Le Loarer F, Watson S, Pierron G, de Montpreville VT, Ballet S, Firmin N, Auguste A, Pissaloux D, Boyault S, Paindavoine S, Dechelotte PJ, Besse B, Vignaud JM, Brevet M, Fadel E, Richer W, Treilleux I, Masliah-Planchon J, Devouassoux-Shisheboran M, Zalcman G, Allory Y, Bourdeaut F, Thivolet-Bejui F, Ranchere-Vince D, Girard N, Lantuejoul S, Galateau-Sallé F, Coindre JM, Leary A, Delattre O, Blay JY, Tirode F. Nat Genet. 2015 Oct;47(10):1200-5. doi: 10.1038/ng.3399. Epub 2015 Sep 7.

Chimeric EWSR1-FLI1 regulates the Ewing sarcoma susceptibility gene EGR2 via a GGAA microsatellite. Grünewald TG, Bernard V, Gilardi-Hebenstreit P, Raynal V, Surdez D, Aynaud MM, Mirabeau O, Cidre-Aranaz F, Tirode F, Zaidi S, Perot G, Jonker AH, Lucchesi C, Le Deley MC, Oberlin O, Marec-Bérard P, Véron AS, Reynaud S, Lapouble E, Boeva V, Rio Frio T, Alonso J, Bhatia S, Pierron G, Cancel-Tassin G, Cussenot O, Cox DG, Morton LM, Machiela MJ, Chanock SJ, Charnay P, Delattre O. Nat Genet. 2015 Sep;47(9):1073-8. doi: 10.1038/ng.3363. Epub 2015 Jul 27.

Genomic landscape of Ewing sarcoma defines an aggressive subtype with co-association of STAG2 and TP53 mutations. Tirode F, Surdez D, Ma X, Parker M, Le Deley MC, Bahrami A, Zhang Z, Lapouble E, Grossetête-Lalami S, Rusch M, Reynaud S, Rio-Frio T, Hedlund E, Wu G, Chen X, Pierron G, Oberlin O, Zaidi S, Lemmon G, Gupta P, Vadodaria B, Easton J, Gut M, Ding L, Mardis ER, Wilson RK, Shurtleff S, Laurence V, Michon J, Marec-Bérard P, Gut I, Downing J, Dyer M, Zhang J, Delattre O; St. Jude Children’s Research Hospital–Washington University Pediatric Cancer Genome Project and the International Cancer Genome Consortium. Cancer Discov. 2014 Nov;4(11):1342-53. doi: 10.1158/2159-8290.CD-14-0622. Epub 2014 Sep 15.

SMARCA4 inactivation defines a group of undifferentiated thoracic malignancies transcriptionally related to BAF-deficient sarcomas. Le Loarer F, Watson S, Pierron G, de Montpreville VT, Ballet S, Firmin N, Auguste A, Pissaloux D, Boyault S, Paindavoine S, Dechelotte PJ, Besse B, Vignaud JM, Brevet M, Fadel E, Richer W, Treilleux I, Masliah-Planchon J, Devouassoux-Shisheboran M, Zalcman G, Allory Y, Bourdeaut F, Thivolet-Bejui F, Ranchere-Vince D, Girard N, Lantuejoul S, Galateau-Sallé F, Coindre JM, Leary A, Delattre O, Blay JY, Tirode F. Nat Genet. 2015 Oct;47(10):1200-5. doi: 10.1038/ng.3399. Epub 2015 Sep 7.

Emergence of new ALK mutations at relapse of neuroblastoma. Schleiermacher G, Javanmardi N, Bernard V, Leroy Q, Cappo J, Rio Frio T, Pierron G, Lapouble E, Combaret V, Speleman F, de Wilde B, Djos A, Ora I, Hedborg F, Träger C, Holmqvist BM, Abrahamsson J, Peuchmaur M, Michon J, Janoueix-Lerosey I, Kogner P, Delattre O, Martinsson T. J Clin Oncol. 2014 Sep 1;32(25):2727-34. doi: 10.1200/JCO.2013.54.0674

Activated Alk triggers prolonged neurogenesis and Ret upregulation providing a therapeutic target in ALK-mutated neuroblastoma. Cazes A, Lopez-Delisle L, Tsarovina K, Pierre-Eugène C, De Preter K, Peuchmaur M, Nicolas A, Provost C, Louis-Brennetot C, Daveau R, Kumps C, Cascone I, Schleiermacher G, Prignon A, Speleman F, Rohrer H, Delattre O, Janoueix-Lerosey I. Oncotarget. 2014 May 15;5(9):2688-702.

Hyperactivation of Alk induces neonatal lethality in knock-in AlkF1178L mice. Lopez-Delisle L, Pierre-Eugène C, Bloch-Gallego E, Birling MC, Duband JL, Durand E, Bourgeois T, Matrot B, Sorg T, Huerre M, Meziane H, Roux MJ, Champy MF, Gallego J, Delattre O, Janoueix-Lerosey I. Oncotarget. 2014 May 15;5(9):2703-13.

Rubinstein-Taybi syndrome predisposing to non-WNT, non-SHH, group 3 medulloblastoma. Bourdeaut F, Miquel C, Richer W, Grill J, Zerah M, Grison C, Pierron G, Amiel J, Krucker C, Radvanyi F, Brugieres L, Delattre O. Pediatr Blood Cancer. 2014 Feb;61(2):383-6. doi: 10.1002/pbc.24765.