Groupe “Helicases DDX17/DDX5 et neuroblastome” de l’équipe ReGArDS (Regulation of Genome Architecture and Dynamics of Splicing)

Ecole Normale Supérieure de Lyon

Membres

• Cyril BOURGEOIS
• Sophie TERRONE
• Jessica VALAT

Thématique de recherche générale et en oncopédiatrie

Fonction des hélicases ARN DDX17 et DDX5 dans la régulation de l’expression des gènes et dans la différenciation des cellules de neuroblastome

Outils, modèles et méthodes d’étude

Manipulation de lignées cellulaires de neuroblastome, analyses moléculaires de l’organisation 3D et de l’expression des gènes, analyses bioinformatiques (RNA-seq, ChIP-seq…)

Collaborations scientifiques nationales / internationales

Valérie Combaret (CRCL, Lyon)

Benjamin Gibert (CRCL, Lyon)

Partenariat avec les équipes cliniques en oncopédiatrie

Aucune

Publication

– Giraud G, Terrone S., Bourgeois CF. Functions of DEAD box RNA helicases DDX5 and DDX17 in chromatin organization and transcriptional regulation. BMB Rep. 51: 613-622 (2018).

– Lambert MP, Terrone S, Giraud G, Benoit-Pilven C, Cluet D, Combaret V, Mortreux F, Auboeuf D, Bourgeois CF. The RNA helicase DDX17 controls the transcriptional activity of REST and the expression of proneural microRNAs in neuronal differentiation. Nucleic Acids Res. 46:686-7700 (2018).

– Tranchevent LC, Aubé F, Dulaurier L, Benoit-Pilven C, Rey A, Poret A, Chautard E, Mortada H, Desmet FO, Chakrama FZ, Moreno-Garcia MA, Goillot E, Janczarski S, Mortreux F, Bourgeois CF*, Auboeuf D*. Exon Ontology: Functional Genomics At Exon Level Resolution. Genome Res. 27:1087-1097 (2017). (* equal contribution).

– Bourgeois CF, Mortreux F, Auboeuf D. The multiple functions of RNA helicases as drivers and regulators of gene expression. Nat Rev Mol Cell Biol. 17:426-38 (2016).

– Dardenne E, Polay Espinoza M, Fattet L, Germann S, Lambert MP, Neil H, Zonta E, Mortada H, Gratadou L, Deygas M, Chakrama FZ, Samaan S, Desmet FO, Tranchevent LC, Dutertre M, Rimokh R, Bourgeois CF*, Auboeuf D.* RNA helicases DDX5 and DDX17 dynamically orchestrate transcription, miRNA, and splicing programs in cell differentiation. Cell Rep. 7:1900-13 (2014). (* corresponding authors).